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轉錄后調控是指在RNA轉錄后對基因表達的調控，是真核生物基因表達的特點之一。
轉錄后形成的原初轉錄物須經過一系列的加工，才能轉變成具功能的成熟mRNA，從而作為蛋白質翻譯的模板。在mRNA的加工成熟過程中，可通過各種不同的機制來調節控制基因表達種類和數量，可根據自身生長發育的需要實現遺傳信息的選擇性表達。
1 核mRNA的5’-帽子形成對基因表達的調控。
mRNA的“帽子”部分為核糖體識別所必需，由此通過核糖體小亞基的滑動以尋找mRNA的起始密碼子。因此，帽子的形成是具帽結構的mRNA翻譯能否進行、表達能否實現的先決條件。帽子的形成能提高mRNA的穩定性。
2 mRNA的3`-poly(A)形成對基因表達的調控。
mRNA中poyl(A)形成的位點（即多聚腺昔酸化信號）選擇不僅決定多聚腺昔酸化的位置和效率，還直接導致基因表達的差異和遺傳的多態性。Poyl(A)在mRNA中的位置變化，還可能通過3’-非翻譯區的變化而影響mRNA的穩定性，從而影響表達效率。多聚腺昔酸化可通過激活翻譯過程，促進基因表達，poyl(A)與poly(A)結合蛋白形成復合物，對控制翻譯和信息穩定性起重要作用。
3 前體mRNA的選擇性剪接與基因表達調控。
真核生物的基因絕大多數是斷裂基因，原始轉錄物中既有外顯子又有內含子，必須經剪接才能產生成熟mRNA。mRNA的選擇性剪接是基因表達的一個具顯著效應的調節機制。直接參與剪接作用的各種snRNA，主要與剪接點的識別、精確定位及剪接反應有關;蛋白質因子的主要作用是協助SnRNA完成剪接反應。
4 mRNA的5`-端及3’-端非翻譯區對基因表達的調控。
mRNA的5`-端及3`-端非翻譯區雖不編碼蛋白質，但在基因表達的調按中是必不可少的，它們可通過多種方式對基因表達進行調控。
mRNA的3`-UTR中有一種促降解順序，可通過富含AU的元件介導加速mRNA的降解。3`-UTR控制辨認特殊密碼子，指導基因的特殊表達；3’-UTR的遺傳性異常，引起基因的異常表達，導致遺傳疾病。5’-UTR參與前體mRNA選擇性剪接，使同種基因形成不同的表達產物、控制某些mRNA的翻譯起始、控制特定基因的特定條件下的表達。
圖1 真核生物基因表達調控過程
mRNA加工成熟后，通過核質運輸轉入細胞質中進行翻譯。
1 RNA加工調控，它僅在真核細胞中發生，由它控制初級轉錄物如何及何時進行剪接形成可用的mRNA。
2 翻譯調控，通過翻譯調控確立哪些mRNA翻譯成蛋白質及什么時候翻譯，例如通過特異的mRNA結合蛋白可以抑制翻譯，或者通過位于mRNA末端的特異核苷酸序列加速核糖體的結合，從而促進翻譯。
3 mRNA降解調控，這可影響到某些mRNA種類的穩定性。
4 蛋白質活性調控，可選擇性地使某些特異的蛋白分子激活、失活、修改、或區域化，從而影響到蛋白質怎樣或何時起作用。