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    RNA pull - down Model Figures

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    RNA   pull-down實驗服務

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    實驗技術流程

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    實驗常見問題

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    結果分析

    對于一幅RNA pull-down實驗結果Figure,應包含位點作用示意圖、WB或質譜結果數據分析圖,并應在Supplement中補充相關的驗證性實驗圖片,具體如下圖所示。

    RNA Pull-down model figure.png

    RNA 序列: G表示空間構象的變化, AS表示互補鏈的的二級結構, S表示正義鏈的二級結構。

     

    Figure A

    用不同的A、AS、G RNA序列去Pulling Down蛋白符合物,并用不同的KCL濃度梯度洗脫。蛋白抗體NCL hnRNP U hnRNP F RPL7 hnRNP K的單抗進行WB實驗。檢測A AS G特定區段的結合的蛋白復合物的組分。

    RNA Pull-down model figure A.png

    Figure B

    RNA Pull down后的將蛋白復合物進行質譜實驗,發現結合蛋白NCL的肽段。不同RNA構象A、AS、G結合的肽段的不同。

    RNA Pull-down model figure B.png

    Figure C

    通過重組NCLGST上,通過GST Pull down 捕獲符合物,進行qRT-PCR檢測RNA片段AS、S、G和細胞組成型表達RNAUnbound RNA GAPDH)。

    RNA Pull-down model figure C.png

    Figure D

    RNA Pull down結果進行SDSPAGE電泳檢測。上面四泳道分別為不同的RNA捕獲方式,UTP生物素化,無生物素化等。

    RNA Pull-down model figure D.png

    Supplement

    A RNA motif(結構域)注釋和motif生物素化結合鏈霉親和素。

    RNA Pull-down model figure S.A.png

    B 在不同的處理條件下(ATP depletion)下進行RNA pulling down后用 CupSmaug 蛋白單抗進行WB檢測。

    RNA pull - down Model Figure S.B.png

    C RNA Pull downRNA探針,在加上Cap帽子結構和不加帽子的情況下捕獲的蛋白用elF4G翻譯延伸因子 CuP蛋白進行WB。有帽子結構的才能有翻譯效應。

    RNA pull - down Model Figure S.C.png


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